Le répertoire www est un raccourci pour certaines applications du serveur vers public_html.
Vous retrouvez ainsi les même fichiers à l'intérieur des deux répertoires.
Cela n'utilise pas deux fois plus de place, ce sont des répertoires dits "mirroirs".
Téléchargez vos fichiers dans public_html pour les rendres accessibles aux utilisateurs. C'est dans ce répertoire que vous devez installer votre site.